Δεν δήλωσε συμμετοχή στη διοργάνωση του Κύπελλο ΕΠΣ Καστοριάς ο ΠΑΟΚ Κωσταραζίου, της νέας αγωνιστικής περιόδου.
Στον φετινό θεσμό, ο οποίος θα περιλαμβάνει τέσσερις ομίλους των τεσσάρων ομάδων με τρία μονά παιχνίδια, αξίζει να σημειωθεί πως από την Α' Κατηγορία θα συμμετάσχουν και οι 13 ομάδες, ενώ από την Β' μόνο 3 (Νέστωρ Νεστορίου, Νέα Καστοριά, Κεραυνός Χιλιοδένδρου).
Η έναρξη της Β' Φάσης του Κυπέλλου ορίστηκε για τις 27 Σεπτεμβρίου 2020 με τους ομίλους να διαμορφόνωνται ως εξής:
Α’ Όμιλος
Κεραυνός Χιλιοδένδρου
Α.Σ. Πεντάβρυσσος
Γράμμος Μαυροχωρίου
Ομόνοια Βογατσικού
Β΄ Όμιλος
Νέστωρ Νεστορίου
Α.Ο. Κάστωρ
Α.Ε. Γραμμοχωρίων
Α.Σ. Νταηλάκης
Γ’ Όμιλος
Ελπίδες Μεσσοποταμίας
Δόξα Αμπελοκήπων
Παναργειακός
Αστραπή Μεσοποταμίας
Δ΄ Όμιλος
Νέα Καστοριά
Α.Ε. Βιτσίου
Δόξα Κορησού
Ηρακλής Πολυκάρπης
